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通常医院所做的肝功能化验指标包括：谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）、碱性磷酸酶（ALP）、γ-谷酰转肽酶（GGT）、白蛋白/球蛋白（A/G）、总胆红素（T-Bil）、直接胆红素（D-Bil）.
反映肝细胞损伤的检查项目以血清酶检测常用,如谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）等等.临床表明,各种酶试验中,以ALT、AST能敏感地提示肝细胞损伤及其损伤程度.反应急性肝细胞损伤以ALT最敏感,反映其损伤程度则AST较敏感.
反映肝脏排泄功能的检查项目检测肝脏对某些内源性（胆红素、胆汁酸等）或外源性（染料、药物等）高摄取物排泄清除能力,临床上常用于胆红素定量的检测.如果胆红素进行性上升并伴ALT下降,提示病情加重,有转为重症肝炎的可能.
反映肝脏贮备功能的检查项目血浆的蛋白（ALb）和凝血酶原时间（PT）是通过检测肝脏合成功能以反映其贮备能力的常规试验.ALb下降提示蛋白合成能力减弱,PT延长提示各种凝血因子的合成能力降低.
反映肝脏间质变化的检查项目γ-球蛋白增高的程度可评价慢性肝病的演变和预后.
此外,透明质酸、板层素、III型前胶原肽和IV型胶原的血清含量,可反映肝脏内皮细胞、贮脂细胞和成纤维细胞的变化,与肝纤维化和肝硬化密切相关.